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FASTA 格式

Mark Renton 更新于: 2020-09-14


序列的最基本格式,只需要一个>符号表示序列开始,后跟序列名称。再换一行内容为DNA或蛋白质序列。

>AB000263 | acc=AB000263|descr=Homo sapiens mRNA for prepro cortistatin like peptide, complete cds.| len=368
ACAAGATGCCATTGTCCCCCGGCCTCCTGCTGCTGCTGCTCTCCGGGGCCACGGCCACCGCTGCCCTGCC
CCTGGAGGGTGGCCCCACCGGCCGAGACAGCGAGCATATGCAGGAAGCGGCAGGAATAAGGAAAAGCAGC
CTCCTGACTTTCCTCGCTTGGTGGTTTGAGTGGACCTCCCAGGCCAGTGCCGGGCCCCTCATAGGAGAGG
AAGCTCGGGAGGTGGCCAGGCGGCAGGAAGGCGCACCCCCCCAGCAATCCGCGCGCCGGGACAGAATGCC
CTGCAGGAACTTCTTCTGGAAGACCTTCTCCTCCTGCAAATAAAACCTCACCCATGAATGCTCACGCAAG
TTTAATTACAGACCTGAA

一个fasta格式的文件也可以包含多条序列:

>seq1
ATCCGGACCGGA
>seq2
CCGGATTGAGGA
>seq3
ACCGGAGATTTG

Reference

  1. http://www.cnblogs.com/ace9/archive/2011/04/29/2032716.html