混合组装

Mark Renton 更新于: 2020-09-14

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结合 illumina 测序和 PacBio/Nanopore 测序数据，可以较容易获得细菌基因组的完成图。常见的混合组装软件：

• spades
• canu

方法

1. spades 组装

(denovo)$ spades.py

2. unicycler 组装

$ conda activate nanopore
(nanopore)$ unicycle -1 -2 -l